2006年，赣南医科大学依托赣南丰富的苏区医疗卫生遗址旧址及相关史料，结合学校思政部门的教学与研究力量，成立专门研究机构，启动苏区医疗卫生工作的系统研究。2010年，学校正式成立苏区卫生研究中心，致力于中央苏区医疗卫生史的深入探索。2012年，农村（社区）医学教育研究中心成立，并于2014年获评为省高校人文社科重点研究基地。2018年，学校整合上述两个中心资源，联合中国社会科学院当代中国研究所，共同成立中央苏区医疗卫生史与健康中国战略研究中心，并获批为省哲学社会科学研究重点基地。2023年，该基地更名为“苏区卫生与健康中国建设研究中心”。

学校每年为研究中心安排专项工作经费，并配备专门办公场所及资料室等，总面积达300多平方米。中心还建有3个集教学、科普、研究功能于一体的实践教学基地，分别为红色卫生史博物馆、人体生命科学馆和中央红色医院旧址。

研究中心坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，聚焦党在苏区时期的医疗卫生工作及当前国家健康战略相关理论与实践问题，持续开展学术研究。现有专兼职研究人员50余人，其中高级职称30余人，90%以上拥有硕士或博士学位。研究团队主持国家社科基金项目7项、国家社科基金重大项目子课题1项，教育部高校人文社科项目2项，获批省级课题33项；在国内外省级以上学术期刊发表论文百余篇，出版著作9部；荣获省教学成果奖一等奖1项、二等奖2项，省社科成果奖一等奖2项、二等奖2项、三等奖3项；举办各类学术活动20余场。